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学知识都是进行好的生物信息学研究的前提.在培养学生时不可忽视对其基础生物学知识的传授和教育,并适当引导其对生物学问题的思考.生物学问题可以很大也可以很小.大的生物学问题任何一个懂得基础生物学知识的人都可以提出,但也是最难解决的,比如到底是什么改变使细胞恶变,自身免疫病是如何形成的,心血管病糖尿病等复杂疾病是如何发生的,为何有人容易生某种病而其他人不易感.小的生物学问题就是各自领域的具体研究课题,比如表观遗传学领域的DNA去甲基化酶是否存在,基因表达调控领域的转录起始频率是如何决定的,RNA领域的大量非编码RNA的作用,蛋白修饰领域新发现的修饰如何调控蛋白的功能等等.在脑中提出并试图思考一系列大大小小的生物学问题是对学生培养目标的第一步.这些问题的产生的前提是对生物学知识的熟悉掌握.然而在对学生培养的过程中没必要也不可能告诉他们所有的知识,生物学知识教育的原则是为他们打开门,当他们思考问题的时候知道去哪里找到相关的知识.

另一方面,只有生物学基础知识和问题是不够的.很多问题在生物信息学产生之前就存在了,传统的方法无法带给人们问题的答案.人们一直期待新的方法去理解和解决这些问题.生物信息学的产生无疑提供给人们另一种思考生物问题的方式,为一些经典问题的解决提供了可能.例如最近的大规模的肿瘤基因组测序和分析使我们发现了很多新的肿瘤相关基因[2].对于生物背景的学生,在教学中要把这样的例子介绍给学生,生物背景的学生在理解信息学理论方面会存在困难.最初很难要求他们理解所有具体过程.但是至少要让他们知道这些方法的基本原理,还有在什么情况下使用.这样在以后的研究中遇到类似问题才能想到应该选择什么样的信息学工具去解决,在具体应用过程中加深对整个过程的理解.生物背景的学生如果想成为生物信息学专家,只会应用是不够的,补充一些计算机、统计、信息方面的基础知识是必不可少的.

生物信息学是一门仍处在快速发展之中的学科.还没有一本教材能够满足生物信息学教学的需要,生物信息学立足于分子生物学、模式识别、计算机科学与技术、数学和统计学等学科,所以学生要先对这些学科的基本概念和系统有一个较为全面和直观的认识,为日后的科研打下坚实的基础.另外,培养过程中要包括大量的实例介绍,对一些重要的应用还加以详细解剖,使得同学们不再仅掌握理论,而是能够学会如何在实际工作中灵活应用这些理论.在此基础之上,向同学们推荐一些最新的论文、期刊、参考读物和相关的学术报告,让同学们能够切身感受到学科发展的前沿,培养学生的创新能力.21世纪是生命科学的时代,也是信息科学的时代.生物信息学在这样的历史条件下产生并壮大,它作为多个领域的交叉新兴学科,对生命科学研究有着巨大的推动力.生物信息学是一门应用性非常强的学科,也是一门非常活跃的前沿学科,良好的教学效果必须以先进的内容体系为基础,我们应时刻注ø

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47;以科研促进教学,教学科研相长,使教学研究达到更高的水平.

[参考文献]

[1]蒋彦等.基础生物信息学及应用[M].北京:清华大学出版社,2003

[2]StrattonM.R.,等.ExploringtheGenomesofCancerCells:ProgressandPromise[J].Science,2011,331(6024):1553-1558.

(作者单位:1.北京大学医学部基础医学院医学信息学系北京2.北京大学医学部基础医学院生化系北京)

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